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EN SAVOIR PLUS ?

Plateforme Imag'IN de l'IUC

La Plateforme Imag'IN de l'Institut Universitaire du Cancer de Toulouse (IUC) est une plateforme technologique labellisée IBiSA qui fournit son expertise pour le design de projets impliquant l'histopathologie, l'anatomie fonctionnelle et l'imagerie biologique. Nous offrons une solution complète et adaptable pour l'acquisition et l'analyse d'images de tissus entiers en lumière transmise ou en fluorescence (imagerie tissulaire à haute résolution).

PLUS D'INFORMATIONS

IMAGERIE DE NOUVELLE GÉNÉRATION

L'histopathologie et l'imagerie fonctionnelle jouent un rôle fondamental dans la recherche biomédicale et le diagnostic de pathologies. La caractérisation précise des tumeurs par des techniques d'imagerie tissulaire permet la validation fonctionnelle de cibles thérapeutiques et l'évaluation préclinique de la réponse aux traitements.

NOS ÉQUIPEMENTS

Imag'IN est équipé de matériel scientifique de pointe dédié à l'histopathologie expérimentale et à l'imagerie digitale haut débit. Pour le stockage et l'analyse des images, la plateforme dispose de noeuds de stockage extensibles et de clusters de calcul haute performance pour exécuter des algorithmes développés en interne ou des solutions commerciales.

3DHISTECH

MarkerCounter

3DHISTECH

FISHQuant

APC

Smart-UPS X 1500

3DHISTECH

Pannoramic 250 Flash II
GBM#-38270

Roche Ventana

Discovery Ultra

Agilent

Autostainer AS48

DELL

PowerEdge R740XD + R640 Servers

3DHISTECH

CaseCenter

DELL + NVIDIA

Tesla P100 16 Go CoWoS

3DHISTECH

SlideConverter

GraphPad Software

Prism

Definiens

Developer XD

Leica

Bond III

Roche Ventana

Benchmark Ultra

Hewlett-Packard

Z820 Workstation
IMA#-0002

QNAP

Turbo NAS TS-879U-RP

Indica Labs

Halo

3DHISTECH

Pannoramic 250 Flash II
GBM#-33648

Agilent

OMNIS

MicroDimensions

3DView (Voloom)

Bitplane

Imaris

QNAP

Turbo NAS TS-879U-RP

Leica

Bond RX

Hewlett-Packard

Z210 Workstation
IMA#-0001

3DHISTECH

Pannoramic Confocal
GBM#-33814

PureStorage

Pure FlashArray//C

Zeiss

AxioScan.Z1
INSERM#-AxioSC

Zeiss

AxioImager.D2
INSERM#-AxioIM

3DHISTECH

HistoQuant

Aperio

GT450-DX
GBM#-34931

NOS SERVICES

Imag'IN propose une expertise pour le développement de méthodes et de techniques de pointe certifiées et validées en pathologie digitale à haut débit.
Toutes les demandes de prestations et les réservations d'équipements doivent être réalisées en ligne via l'app Imag'IN après identification sur le site de la plateforme.

Histopathologie expérimentale

Colorations diverses, IHC/IF multiplex, FISH, RNAscope, etc... Validation des méthodes selon les normes qualité NordiQC et ISO 15189.

Imagerie digitale

Acquisition ultra haut-débit d'images de lames entières en lumière transmise et en fluorescence multiplex champ large et confocale.

Analyse d'images

Analyse d'images quantitative de sections de tissus entiers. Morphologie, machine-learning, classification, segmentation, analyse spatiale, etc...

Plans de formation

Formations à divers équipements et logiciels (automates d'IHC, microscopes, analyse d'image, analyse statistique, etc...).

Système de réservation

Système de réservation en ligne permettant de réserver de manière autonome les équipements et logiciels sur lesquels l'utilisateur est formé.

Open-source data science

Développement d'algorithmes (machine-learning, deep-learning, etc...). Valorisation de l'analyse d'échantillons biologiques par des procédures d'exploration et de fouille de données.

IMAG'IN EST AUSSI UN SGL

Nous fournissons un support technique complet pour le marquage de cibles biologiques, l'acquisition et l'analyse d'images de tissus entiers en lumière transmise ou en fluorescence en utilisant des méthodes d'analyse d'images quantitatives modernes, et des systèmes sécurisés d'accès à distance et de partage pour vos images. Mais, Imag'IN est aussi un Système de Gestion de Laboratoire (SGL) dédié aux activités d'imagerie en pathologie clinique et en recherche, et qui garantie productivité, qualité et traçabilité.

PLUS D'INFORMATIONS

Nos services sont ouverts à l'ensemble de la communauté scientifique
(pathologistes, universitaires et entreprises privées).

L'ÉQUIPE IMAG'IN

Nous développons des technologies de pointe et des méthodes automatiques standardisées et certifiées pour les marquages histologiques, ainsi que pour l'acquisition et l'analyse d'images de tissus entiers. Nous créons des partenariats de recherche institutionnels et industriels, afin de promouvoir les collaborations et le partage d'expertise.

Pierre
BROUSSET

Pathologiste
Responsable Scientifique

PU-PH, MD, PhD

François-Xavier
FRENOIS

Ingénieur en Chef
Responsable Imagerie & Administratif

PhD

Nathalie
VAN ACKER

Chef de Projet
Responsable Histologie & Qualité

PhD

Camille
FRANCHET

Pathologiste
Médecin Référent

PH, MD

Annie
ALLOY

Assistante Ingénieur
Histologie & Imagerie

Stéphanie
GRENARD

Technicienne de Laboratoire
Histologie & Imagerie

Maria del Pilar
ORTEGA ARÉVALO

Étudiante en Thèse
Mathématiques & Informatique

MSc

Laurent
DESMET

Étudiant en Thèse
Mathématiques & Informatique

MSc

NOTRE PROCESS

L'app Imag'IN permet à notre équipe de traiter l'activité de la plateforme Imag'IN et de garantir les normes de qualité requises. Toutes les demandes de prestations et les réservations d'équipements doivent être réalisées en ligne via l'app Imag'IN après identification sur le site de la plateforme. Pour les projets de grande ampleur faisant appel au développement spécifique de techniques de marquage, d'imagerie ou d'analyse, une rencontre avec les responsables de projet est systématiquement organisée.

1

Rencontre

2

Planification

3

Design expérimental

4

Développement

5

Marquage
Scan & Analyse

6

Livraison des données

À PROPOS

Imag'IN développe des technologies de marquage de cibles biologiques, d'acquisition d'image en 2D et en 3D, et des algorithmes d'analyse innovants (morphologie mathématique, machine-learning). Bienvenue dans l'ère de la microscopie fonctionnelle et de l'imagerie de nouvelle génération !

Portfolio

Cellules de mélanomes attaquées par des CTLs
Piles d’images multispectrales acquises sur une épaisseur totale de 16 µm avec un scanner de lames confocal (Pannoramic Confocal, 3DHISTECH), puis reconstruites en 3D et ségmentées à l’aide d’Imaris (Bitplane) - DAPI en blanc/gris, cellules de mélanome en cyan, tubuline en vert, CD8 en rouge, perforine en bleu
©2011 Dr François-Xavier FRENOIS

Plateforme Imag'IN

De la prise en charge des échantillons biologiques jusqu'à leur analyse anatomique et fonctionnelle, Imag'IN propose une expertise pour le développement de méthodes et de techniques de pointe certifiées et validées en pathologie digitale à haut débit.

  • Histopathologie expérimentale (colorations, IHC/IF, FISH, RNAscope…)
  • Imagerie haute résolution de lames entières en lumière transmise (fond clair)
  • Imagerie haute résolution de lames entières en fluorescence à champ large et confocale
  • Analyse anatomique et fonctionnelle quantitative (exploration, fouille de donnée)
  • Intelligence artificielle (machine-learning, deep-learning)
PLUS D'INFORMATIONS

Imag'IN utilise des cookies de session et recueille certaines données personnelles à des fins d'analyse.

Système

Navigateur

Géolocalisation

IP PUBLIQUE & PRIVÉE

Autres données

NOS PRINCIPAUX PARTENAIRES

Imag'IN collabore avec de nombreux instituts publics et compagnies privées (startups, big-pharmas...), et en particulier avec l'industrie pharmaceutique.

INFOS & NOMBRES

Chaque point sur cette carte identifie un visiteur du site web Imag'IN par ses coordonées GPS :)

Thématiques

  • Histologie
  • Anatomopathologie
  • Histopathologie expérimentale
  • Imagerie digitale de sections tissulaires entières
  • Imagerie de lames entières
  • Analyse d'images quantitative
  • Intelligence artificielle
  • Diagnostic des cancers

Mots clés

  • Pathologie digitale
  • Imagerie cellulaire & tissulaire
  • Imagerie de fluorescence
  • Imagerie confocale
  • Immunohistochimie
  • Immunofluorescence multiplex
  • Machine learning / Deep learning
  • Data science
  • Qualité

Imag'IN infos

Des méthodes et des techniques de pathologie digitale à haut débit : histopathologie expérimentale, imagerie de tissus entiers en lumière transmise et en fluorescence, analyse anatomique et fonctionnelle quantitative (intelligence artificielle).

  • Tutelles : CHU de Toulouse
  • Labellisation IBiSA : Depuis 2014
  • Responsable Scientifique : P. Brousset - MD, PhD
  • Responsable Imagerie & Administratif : FX. Frenois - PhD
  • Responsable Histologie & Qualité : N. Van Acker - PhD
Plateforme affiliée
Utilisateurs
Projets
Lames histologiques
Microscopes & Scanners
Réservations

APP IMAG'IN

Un logiciel dédié aux plateformes d'imagerie pour faire face à vos activités, améliorer vos flux de travail et la gestion de la qualité.

Quels avantages pour vos activités d'imagerie ?
Avec les progrès récents de la pathologie digitale, les activités d'imagerie sont désormais regroupées au sein de plateformes de service, qui doivent fournir leur expertise à différents scientifiques (pathologistes, vétérinaires, chercheurs ou enseignants). L'imagerie génère de gros volumes de données et ne peut plus être considérée comme une activité artisanale. Elle doit être gérée de manière quasi-industrielle, à l'aide de processus standardisés, et en prenant soin de la traçabilité et de l'assurance qualité. Fournir des services d'imagerie pour des scientifiques d'horizons diverses qui ont des besoins spécifiques implique de pouvoir gérer l'activité avec flexibilité et avec des flux de travail adaptés. Forts de cette vision, nous avons développé le système de gestion de laboratoire Imag'IN, qui est spécifiquement conçu pour les plateformes d'imagerie.

Vous êtes le manageur d'une plateforme d'imagerie ?
Veuillez trouver ci-dessous nos plans d'abonnement, et contactez-nous pour plus d'informations.

  • Abonnement Annuel
    Bronze
  • 50 utilisateurs
  • projets d’imagerie
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  • -
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  • statistiques de base
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  • -
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    Silver
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  • -
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    Platinum
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ENTRONS EN CONTACT

Bienvenue cher visiteur. N'hésitez pas à utiliser le formulaire ci-dessous pour nous contacter. Nous vous répondrons dans les meilleurs délais.

Contact

Plateforme Imag'IN de l'IUC

Institut Universitaire du Cancer Toulouse Oncopôle
1, Avenue Irène Joliot Curie
31059 CEDEX 9 Toulouse
France

T# : +33 (0) 5 31 156 408

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